| # | Title | Rating | Length |
|---|
| 1 | オープニング（全滅した科学アカデミー研究所） | | 0:25 |
| 2 | タイトル | | 1:21 |
| 3 | スーパーメトロイドのテーマ | | 3:28 |
| 4 | サムス・アラン登場ファンファーレ | | 0:06 |
| 5 | 惑星ゼーベス クレテリア到着 | | 2:47 |
| 6 | 静寂 | | 0:57 |
| 7 | アイテム取得ファンファーレ | | 0:06 |
| 8 | クレテリア 宇宙海賊出現 | | 3:43 |
| 9 | ブリンスタ 植物密生エリア | | 3:47 |
| 10 | 小ボス対決BGM（スポア・スポーン/ボツーン） | | 2:18 |
| 11 | ブリンスタ 赤土湿地エリア | | 3:54 |
| 12 | 大ボス対決BGM（クレイド/クロコマイアー/ファントゥーン） | | 1:07 |
| 13 | ノルフェア 灼熱の溶岩エリア | | 2:26 |
| 14 | 宇宙戦士 サムス・アランのテーマ | | 3:46 |
| 15 | 難破船 | | 4:39 |
| 16 | マリーディア 岩の地下水エリア | | 3:02 |
| 17 | マリーディア 流砂の地下水エリア | | 4:02 |
| 18 | ノルフェア 古代遺跡エリア | | 4:41 |
| 19 | 大ボス対決BGM（リドリー/ドレイゴン） | | 1:25 |
| 20 | サムス・アラン最後の叫び | | 0:04 |
| 21 | 謎の彫像部屋 | | 1:44 |
| 22 | ツーリアン | | 3:57 |
| 23 | 緊張 | | 1:18 |
| 24 | マザーブレイン | | 2:29 |
| 25 | 脱出 | | 1:13 |
| 26 | 惑星ゼーベス爆発 | | 0:21 |
| 27 | 任務完了 | | 0:18 |
| 28 | エンディング | | 3:04 |
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